Sono collegati in serie da una catena di trasporto degli elettroni e differiscono nell'organizzazione dei sistemi di raccolta della luce e nella composizione dei pigmenti. I due pigmenti presenti nei fotosistemi delle alghe verdi sono le clorofille e i carotenoidi (Green e Durnford, 1996). La clorofilla è il pigmento principale che ha la funzione di intrappolare l'energia luminosa ed è presente in due forme; clorofilla a (Chl a) e clorofilla b (Chl b), e possono essere distinte in base ai loro spettri di assorbimento. Chl a ha un massimo di assorbimento di 659 nm e 429 nm mentre Chl b ha un massimo di assorbimento di 642 nm e 455 nm (Zscheile e Comar, 1941). La presenza di due pigmenti con diversi massimi di assorbimento funziona per ampliare la gamma di luce che può essere assorbita e utilizzata per la fotosintesi. I carotenoidi sono presenti anche nei fotosistemi e oltre a servire come apparato per la raccolta della luce, i carotenoidi sono coinvolti nella dissipazione di energia in presenza di luce in eccesso (Santabarbara et al.,